Родился в  Курляндской губернии. Происходил из старинного рода дворян, покинувших Францию вл времена Людовика XIV.
Получил образование в Морском кадетском корпусе и Офицерском классе (позднее Николаевская морская академия).
С юношеских лет Колонг увлекался математикой и после окончания в 1861 году Офицерского класса прослушал математический курс в Петербургском университете.

С появлением броненосных и железных кораблей обычный магнитный компас перестал быть надежным указателем направления пути судна. Колонг занялся изучением магнетизма металлических кораблей и блестяще решил ряд сложнейших вопросов по девиации и предложил способ ее уничтожения. Результаты его исследований были опубликованы в «Морском сборнике» и использованы при составлении соответствующего руководства, став достоянием всех флотов мира.

Создал прибор для уничтожения девиации – инклинатор. В 1882 году он продемонстрировал изобретенные им инструменты императору Александру III, который наградил его компасом, усыпанным бриллиантами с вензельным изображением имени царя.

В том же году Российская АН присудила ему Ломоносовскую премию. В отчете по поводу этого присуждения говорилось, что «труды г. Де-Колонга принадлежат к числу таких, которыми и само значение премии возвышается». Академия признала, что «г. Де-Колонг многолетними трудами, требовавшими глубоких математических познаний и остроумных соображений, подвинул значительно вперед теорию девиации и достиг важных практических результатов на пользу военного и торгового флотов, дав простое и надежное средство определить и уничтожить вредное влияние судового железа и тем самым обеспечил в этом отношении безопасное плавание судов».

С 1886 года Колонг фактически руководил компасным делом в русском флоте. В 1889 году он был назначен заведующим компасным делом в мастерской мореходных инструментов при ГГУ. Оценкой научного значения трудов Колонга явилось избрание его в 1896 году членом-корреспондентом Российской АН по физическому разряду. Научную работу Колонг с успехом совмещал с преподавательской деятельностью в Николаевской морской академии.
Другой стороной его деятельности явилась работа в эмеритальной кассе Морского ведомства, где ему были поручены сложные математические расчеты для определения суммы пенсий и различных льгот. На базе теории вероятности и статистических данных Колонг составил практические расчетные формулы, правильность которых подтвердила жизнь. За эти свои труды в 1871 году Колонг был награжден орденом Св. Владимира 4 степени. В 1893 году ему присвоили звание генерал-майора, а незадолго до этого он занял пост заместителя начальника ГГУ.

В честь него названы: полуостров и мыс (Де-Колонга) на полуострове Заря на берегу Харитона Лаптева полуострова Таймыр (названы РПЭ Э.В. Толля в 1900 году после проведения компасной съемки); бухта на берегу Харитона Лаптева на полуострове Де-Колонга (названа не позже 1962 года советскими исследователями).

У Саитова он фигурирует в "Петербургском некрополе" как  "Клапье-де-Колонг, Иван Петрович, генерал-майор, р. 22 февраля 1839 ✝ 13 мая 1901 Надпись по-русски".

Могила утрачена.